Molekulárně cytogenetické vyšetření, které provádíme na čerstvých bioptických tkáních (core cut biopsy) i na tkáních zalitých do parafinu (FFPE). Tkáňové řezy převážně vyšetřujeme metodou FISH pro předchozí deparafinizaci. Tímto způsobem je možno vyšetřovat i archivní tkáň, což skýtá velké možnosti jak pro výzkum, tak pro klinické využití, kdy můžeme analyzovat i diagnostické tkáně od pacientů, kteří zrelabovali po dlouhé době od primární diagnózy a molekulárně cytogenetické vyšetření u nich v té době nebylo provedeno. Výsledky hodnotíme fluorescenčním mikroskopem a zpracováváme pomocí obrazové analýzy, kdy nedílnou součástí námi používaného programu je archivace nálezů.
Po úspěšném zavedení metody deparafinizace vzorků jsme v roce 2001 ve spolupráci s firmou Vysis zorganizovali workshop s touto tematikou. Pro velký zájem jsme workshop s metodiku FISH a nově CGH v roce 2007 opakovali, jako součást 3. sympózia molekulární patologie.